Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sike1Q9CPR7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms