Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Bcl11bQ99PV8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bcl11bQ99PV8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms