Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtf2a1Q99PM3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gtf2a1Q99PM3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms