Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GpnmbQ99P91 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GpnmbQ99P91 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms