Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Tdrd1Q99MV1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Tdrd1Q99MV1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Tdrd1Q99MV1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Tdrd1Q99MV1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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Tdrd1Q99MV1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tdrd1Q99MV1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tdrd1Q99MV1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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