Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tm2d1Q99MB3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tm2d1Q99MB3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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