Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnpo2Q99LG2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnpo2Q99LG2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms