Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nmd3Q99L48 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nmd3Q99L48 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms