Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ciao1Q99KN2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ciao1Q99KN2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Ciao1Q99KN2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ciao1Q99KN2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms