Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TirapQ99JY1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms