Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krcc1Q99JT5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms