Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Def8Q99J78 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms