Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Apobec3Q99J72 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec3Q99J72 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms