Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tspan1Q99J59 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tspan1Q99J59 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms