Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim11aQ99J19 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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Smim11aQ99J19 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim11aQ99J19 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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