Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim7Q923T7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trim7Q923T7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms