Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Sf3b5Q923D4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sf3b5Q923D4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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