Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nrif1Q923B3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nrif1Q923B3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms