Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Prpf3Q922U1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Prpf3Q922U1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms