Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smarca5Q91ZW3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smarca5Q91ZW3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms