Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cts3Q91ZD5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cts3Q91ZD5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms