Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf6Q91YR7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prpf6Q91YR7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms