Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Setd3Q91WC0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms