Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pth2Q91W27 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms