Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApofQ91V80 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms