Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 298.4 ms