Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smg8Q8VE18 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms