Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam20bQ8VCS3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam20bQ8VCS3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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