Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCM7

Fgg, Fibrinogen gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FggQ8VCM7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FggQ8VCM7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms