Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApobrQ8VBT6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApobrQ8VBT6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms