Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc58Q8R3Q6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ccdc58Q8R3Q6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ccdc58Q8R3Q6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc58Q8R3Q6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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