Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mterf3Q8R3J4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mterf3Q8R3J4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms