Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1Q0

Stx19, Syntaxin-19, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx19Q8R1Q0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Stx19Q8R1Q0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx19Q8R1Q0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx19Q8R1Q0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx19Q8R1Q0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Stx19Q8R1Q0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms