Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg10Q8R1P4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms