Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CipcQ8R0W1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms