Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b4Q8QZY9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b4Q8QZY9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms