Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4C9

Vmn1r192, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r192Q8K4C9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r192Q8K4C9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r192Q8K4C9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms