Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Casc3Q8K3W3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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