Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rdh16f2Q8K3M1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms