Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MyripQ8K3I4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MyripQ8K3I4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms