Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nsl1Q8K305 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nsl1Q8K305 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms