Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brd3Q8K2F0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Brd3Q8K2F0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms