Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rasgef1bQ8JZL7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rasgef1bQ8JZL7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms