Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Mterf1aQ8CHZ9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Mterf1aQ8CHZ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mterf1aQ8CHZ9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mterf1aQ8CHZ9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms