Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csnka2ipQ8CH19 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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