Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Upp2Q8CGR7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Upp2Q8CGR7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms