Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE3

Rcor1, REST corepressor 1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcor1Q8CFE3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rcor1Q8CFE3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rcor1Q8CFE3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rcor1Q8CFE3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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