Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ercc8Q8CFD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ercc8Q8CFD5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ercc8Q8CFD5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ercc8Q8CFD5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ercc8Q8CFD5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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