Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Snx8Q8CFD4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Snx8Q8CFD4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Snx8Q8CFD4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Snx8Q8CFD4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Snx8Q8CFD4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx8Q8CFD4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Snx8Q8CFD4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx8Q8CFD4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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