Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF98

Colec10, Collectin-10, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec10Q8CF98 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Colec10Q8CF98 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Colec10Q8CF98 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms